当深呼吸时肾虚有疼痛感化，可能因为肾盂肾盏部位有结石，所以在深呼吸的时候造成肾脏移动，从而导致结石摩擦，最后出现肾痛的感觉。建议及早的就医，明确诊断再行治疗。