三个月的宝宝肛门很红，这样的话要考虑上火的情况比较大，也有可能大小便没有及时清理的原因，可以用温水清洗，然后外抹红霉素眼膏看看或者是护臀膏，近期尽量少穿纸尿裤，及时清理好大小便，必要时去医院检查一下。